Tabla de Contenidos
Dette er en af de mest populært kendte processer til at udvinde plantegenetisk materiale og være i stand til at observere det under et mikroskop. Den kan også laves med tomater, passionsfrugt eller andre frugter. En banan bruges i dette tilfælde på grund af den enkle måde at håndtere den på og de få trin, der kræves for at knuse den i vores eksperiment.
For at udvinde DNA fra en plantain eller banan skal du bruge:
- En plantain eller banan.
- En meget skarp kniv.
- En gaffel eller en kartoffelmoser.
- Flydende vaskemiddel eller vaskesæbe.
- Mineralvand.
- En lille smule salt.
- Natriumbicarbonat.
- En tragt.
- Køkkenpapir eller papirfiltre.
- Meget kold alkohol.
- Beholdere af ethvert materiale til at udføre trinene. En vil være nødvendig for den mosede banan og en anden til sæbe og natrium. Det er nyttigt, hvis du laver den endelige blanding i en klar beholder, hvor du nemt kan se indholdet udefra.
- Glas- eller plaststrå, gerne gennemsigtigt. Alternativt er det også en god idé at have en strikkepind med et krogpunkt ved hånden.
Husk at undgå at bruge redskaber, der kan være forurenet til at knuse frugten. En ostehøvl kan for eksempel have spor af fedt, når den bruges, og vi ønsker ikke, at disse skal forurene den endelige prøve.
Trin
- Det første trin vil bestå i at skære bananen i små stykker. Dernæst er det praktisk at knuse bananen, så det er en puré. Ved at gøre dette vil du bryde cellerne i denne frugt, som indeholder DNA’et.
- I betragtning af, at celler generelt er dækket af en lipidmembran, vil vi have brug for en yderligere metode til at bryde dem mere grundigt. Til dette vil vi i det næste trin lave en løsning i en separat beholder. Denne løsning kaldes ofte lysisbuffer i akademiske kemikredse.
For at lave lyseringsbufferen skal vi tage flydende sæbe eller vaskesæbe og en kop mineralvand og fortynde det. Hvis det er væsken, vil to stråler af det være tilstrækkeligt til at farve vandet. Hvis det er pulvervaskemiddel, vil en dybt spiseskefuld være nok.
Vaskemidlet vil udføre funktionen med at trække lipider (som er en type fedt) og proteiner (en type essentielle makronæringsstoffer), der er opløselige i lipider. Vi skal også tilføje to teskefulde salt og seks teskefulde bagepulver til denne blanding. Natriumet i disse to forbindelser, med dets positive ioner, letter integriteten af de strenge, der udgør DNA. Det er især bicarbonatet, der skal stå for neutralisering af opløsningens pH, for at forhindre, at DNA’et bliver beskadiget. DNA-strengene er nu ubeskyttede, fordi de er blevet strippet for de lipider, der plejede at belægge dem.
- Vi vil nu ty til en fysisk adskillelsesmetode. Det, vi skal gøre, er at tilføje det biologiske materiale, som vi ekstraherede i trin 1, til vores vaskemiddelopløsning. Vi tager fire spiseskefulde og blander dem i mindst tre minutter, med maksimalt fem minutter.
Med køkkenpapiret eller kaffefiltrene som et rudimentært filter og ved hjælp af en tragt placerer vi et af disse filtre i tragten og hælder væsken af vores blanding i beholderen. Det vil være fra denne blanding, at vi endelig vil udtrække DNA-prøven, der skal observeres.
På dette tidspunkt vil vi have vores opløsning i en vandig fase, og vi kan nemt indsamle vores genetiske materiale. Opløsningen indeholder RNA, DNA og nogle proteiner, der er opløselige i vand.
kemisk adskillelse
Nu vil vi forklare den kemiske separationsmetode, idet vi drager fordel af de kemiske egenskaber ved molekylerne i det biologiske materiale, som vi skal separere. Vi vil bruge 5 ml af opløsningen, som vi lige har filtreret. Vi blander med en mængde kold alkohol, der tredobler det i volumen, i dette tilfælde 15 ml. Alkoholens kolde temperatur vil garantere en bedre udførelse af metoden. Fordi den del af den biologiske opløsning, der indeholder DNA, ikke er opløselig i alkohol, vil vi se, hvordan den agglomererer og adskilles fra de andre grundstoffer og danner et lag, der er let genkendeligt med det blotte øje.
Det er vigtigt at overveje, at alkoholen skal tilsættes langsomt, helst ved at glide den langs kanterne af beholderen, hvor den vandige opløsning venter. Vi prøver også ikke at beskadige DNA’et, som vi måske vil se under et mikroskop senere.
Nu hvor vi kan skelne den uklare opløsning, der bærer DNA’et fra vores prøve, vil vi fortsætte med at ekstrahere det fra det vandige medium. Vi tager strået og introducerer det i det vandige medium, indtil det rører ved den tidligere tilberedte opløsning. Umiddelbart derefter dækker vi den yderste ende af sugerøret med en finger for at dække luftlækagen, og at den tjener til at holde opløsningen. Hvis vi ikke er i stand til at få opløsningen til at klæbe til spidsen af strået, trækker vi den ud uden nogensinde at fjerne vores finger fra den anden ende og fortsætter med at gentage processen og sørger for, at halmen i det mindste synligt er kommet ind i det tætte medium, der indeholder materialet genetisk. Vi placerer vores finger i den modsatte ende, dækker den godt, og forsøger lidt efter lidt at udtrække dette medium fra den vandige opløsning, idet vi langsomt bevæger halmen udad.
Det er sandsynligt, at vi får svært ved at fange denne sidste opløsning, så hvis vi ikke lykkes med den tidligere metode, kunne vi bruge strikkepinden med krogen nedad til at trække denne tykke del af opløsningen ud af det vandige medium.
Vi har nu vores plante-DNA-løsning klar til at blive set under et mikroskop. Det anbefales straks at placere det i et petriskål eller lignende redskab for at undgå kontaminering.
Referencer
Uddanne og skabe. (s/k). Hvordan udvinder man DNA fra en plante? Tilgængelig på: https://www.educaycrea.com/2015/09/como-extraer-el-adn-de-un-vegetal/
Ochoa, J. (2010). DNA-ekstraktion med køkkenmateriale. Tilgængelig: https://www.youtube.com/watch?v=PkjtFM_UVxk&t=243s